Кафедра организована в 1938 году, первым заведующим был профессор  А.А.Бекрицкий (1938-1953). В дальнейшем кафедрой заведовал профессор  В.К. Трутнев (1953-1960).  В 1962 г. на базе ЛОР-отделения ГКБ № 50 начала работать кафедра оториноларингологии Московского медико-стоматологического института (ныне Московский государственный медико-стоматологический университет - МГМСУ). В 1962 г. кафедру возглавил  проф. Е.Н. Мануйлов. В 1970-1982 гг. кафедрой оториноларинголо­гии заведовал канд. мед. наук, доцент Ю.Н. Волков, а в 1982-1988 гг. -  проф. Ю. М. Овчинников.

Работа кафедры всегда была направлена в первую очередь на решение смежных вопросов патологии ЛОР-органов и зубочелюстной системы. При проф. Е.Н. Мануйлове впервые в стране начали разрабатываться вопросы хирургического лечения невралгии тройничного нерва. С 1988 г. по 2006 г. кафедрой руководил заслуженный врач РФ, академик Международной академии оториноларингологии, доктор мед. наук, проф. Р. Г. Анютин.

Профессор Р.Г. Анютин прошел стажировку в ведущих оториноларингологических клиниках Швеции (Стокгольм, Гетеборг, Упсала), в ЛОР-клинике Гютенбергского университета в г. Майнце (Германия). Профессор Р.Г. Анютин выступал с научными докладами на всемирных и европейских конгрессах оториноларингологов. Он является почетным членом Общества ринологов России.

Сотрудники кафедры - высококвалифицированные врачи и ученые. Канд. мед. наук, доцент В.М. Фролов - заслуженный врач РФ. Доценты A.M. Корниенко, д.м.н. В.Н. Талалаев, В.А. Рябинин, ассистенты - В.Н.Костюк, Э.В.Синьков, Р.А.Корниенко, С.С.Егиян.  Коллектив кафедры активно разрабатывал и внедрял в практическое здравоохранение все новое и передовое, что есть в мировой и отечественной оториноларингологии: криовоздействие, ультразвуковая дезинтеграция, радиохирургия,  слухосохраняющие и слухоулучшающие операции, эндоназальное удаление юношеской ангиофибромы основания черепа, эндоларингеальная микрохирургия доброкачест­венных новообразований гортани, эндоскопичес­кие хирургические операции в полости носа и на околоносовых пазухах. В настоящее время коллективом кафедры получены патенты на изобретения: «Способ диагностики экссудативного среднего отита» (2000), «Способ определения эффективности лечения больных с обострением двустороннего хронического гнойного среднего отита» (2001), «Способ микрохирургии гортани» (2002).

С 1996 г. дополнительной базой кафедры становится ЛОР-отделение городской клинической больницы №70. Появление новой клинической базы позволило значительно улучшить качество преподавания специальности.

С 2006 г. кафедрой заведует проф. Вишняков Виктор Владимирович. В течение последних лет  кафедра активно внедряет современные методы преподавания с применением мультимедийной техники, современные методы лечения с использованием микро- и эндоскопической хирургической техники, лазера, видеотехники, что позволяет повысить качество преподавания оториноларингологии студентам, ординаторам и аспирантам.