Лаборатория атеротромбоза создана в 2013 году для выполнения научно-исследовательской работы по направлению «Иммунные и вирусные механизмы атерогенеза» в рамках гранта Правительства Российской Федерации (договор № 14.B25.31.0016 от 15 июля 2013 года). Основным направлением научной деятельности лаборатории является изучение роли иммунных и вирусных механизмов в биологии атеросклероза. Ведущим ученым проекта является известный российский и американский вирусолог, доктор биологических наук, профессор Леонид Борисович Марголис, заведующий отделом межклеточных взаимодействий Национального Института Детского Здоровья и Развития Человека (NICHD), Национальных Институтов Здоровья (NIH), заместитель директора центра трехмерного культивирования тканей Национальных Институтов Здоровья (NASA\NIH) США.

Исполнитель гранта - кафедра кардиологии факультета последипломного образования (ФПДО) МГМСУ. Заведующий кафедрой, профессор Александр Вадимович Шпектор и профессор кафедры Елена Юрьевна Васильева владеют знаниями не только в области фундаментальной биологии тканей, биомедицинских механизмов развития атеросклероза, но также в области клинической кардиологии. В руководимой ими клинике (кафедра кардиологии, Центр атеротромбоза) концентрируется большое количество пациентов, страдающих атеросклерозом различной локализации.

Сотрудничество между профессором кафедры кардиологии ФПДО МГМСУ Е.Ю.Васильевой и профессором Л.Б.Марголисом началось более 30 лет назад. Результаты проделанной работы публиковались в ведущих научных журналах Cell и Proc. Natl. Acad. Sci. USA. В настоящее время налажено сотрудничество кафедры кардиологии ФПДО МГМСУ и лаборатории Клеточной и Молекулярной Биологии NICHD, NIH под руководством профессора Л.Б.Марголиса. В течение нескольких лет Леонид Борисович регулярно читает лекции и проводит семинары для студентов и преподавателей МГМСУ.

Научно-практическое взаимодействие российской и американской лабораторий способствовало тому, что в 2011 и 2012 годах кафедра кардиологии ФПДО МГМСУ победила в открытых конкурсах на заключение государственного контракта в рамках Федеральной целевой программы «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России 2009-2013». Руководителем научно-исследовательской работы по теме: «Роль герпес-вирусов в формировании атеросклеротических бляшек» является профессор Л.Б.Марголис, руководителем работы по теме «Клеточные механизмы прогрессии атеросклероза: роль различных субтипов лимфоцитов» - профессор Е.Ю.Васильева. Благодаря грантам работа в лабораториях продолжается и уже получены многообещающие результаты, которые послужат основой для дальнейших научных исследований.