28—29 октября 2009 г. кафедрой философии, биомедицинской этики и гуманитарных наук МГМСУ совместно с Московским философским обществом и Институтом философии РАН была проведена 3-я Ежегодная научно-практическая конференция "Философские проблемы биологии и медицины: традиции и новации". В конференции приняли участие более 90 представителей таких крупных научных и учебных учреждений, как Институт философии РАН, МГУ им. М.В. Ломоносова, МГМСУ, РГМУ им. Н.И. Пирогова, МАА им. И.М. Сеченова, медицинские университеты и академии Воронежа, Красноярска, Курска, Саратова, Томска и других городов России и ближнего зарубежья. На конференции обсуждались проблемы соотношения традиций и новаций в медико-биологическом знании: возрождение традиций отечественной философии, биологии и медицины, формирование нового научного сообщества в этой области, статус теоретического знания медико-биологических дисциплин, становление новой парадигмы философии медицины. 
В докладах участников конференции анализировались традиционные и инновационные подходы в исследованиях по таким направлениям, как трансдисциплинарные основания биомедицинского знания; био-философия; физика живого и квантовый подход; биоэтика и медицинская этика; биополитика; интегральный подход в биомедицине; биомедицинская виртуалистика; когнитивный подход и биомедицина; теоретическая биомедицина; психосоматическая медицина; медицина здоровья (саномедицина); социальная медицина и философия здоровья; история медицины; биомедицинское образование. Издан сборник конференции ("Философские проблемы биологии и медицины. Вып. 3: Традиции и новации. М. : Принтберри, 2009. 584 с.), в который вошли 176 статей 228 авторов. Во вступительном слове к участникам конференции, которая начала свою работу в зале заседаний Ученого совета Института философии РАН (Москва, ул. Волхонка, 14), д.ф.н., проф., зав. кафедрой философии, биомедицинской этики и гуманитарных наук МГМСУ В.И. Моисеев отметил, что проведение конференции становится доброй традицией, с каждым годом расширяется круг авторов сборника конференции (1-я конференция — 58 авторов, 2-я — 135, 3-я — 228), а также география ее участников (на 3-й конференции представлены более 20 городов России, ближнего и дальнего зарубежья). Цель проведения подобных мероприятий — возрождение традиций и создание новой парадигмы отечественной философии биологии и медицины в нашей стране. 
Продолжая и возрождая лучшие традиции отечественной философии биологии и медицины, подчеркивая органичность и диалектичность знания биомедицинских наук, участники конференции полны решимости развивать новую парадигму философии биомедицины, использовать новые философские направления, формировать новое научное сообщество, активно привлекая к решению этих задач молодых исследователей. Особенно важно, что в конференции приняли активное участие не только представители ведущих научных институтов, заведующие кафедрами, научные сотрудники, медики, представители различных междисциплинарных направлений современной науки, но также молодые ученые — аспиранты и студенты. Три автора лучших работ, включенных в сборник тезисов докладов конференции, были награждены Почетными грамотами и призами (книгами): А.С. Шацких, магистрант кафедры биохимии и физиологии клетки Воронежского государственного университета (тема доклада: "Аксиосоматическая гипотеза и идея развития"); В.А. Карпин, д.м.н., профессор, зав. кафедрой факультетской терапии Сургутского государственного университета (тема доклада: "Теоретическая схема как методологическая конструкция патологического процесса"); З.А. Кулиев, к.ф.н., доцент кафедры философии и политологии ММА им. И.М. Сеченова (тема доклада: "Проблемы философской рефлексии на биоэтику").
На Пленарном заседании, в докладе профессора В.И. Моисеева "Традиции и новации в философии биомедицины" была прослежена история биомедицинского знания с точки зрения различных направлений холизма и редукционизма, отмечена тенденция конвергенции этих направлений, сделан прогноз о возможном их слиянии в будущем. Были отмечены линии эволюции отечественной философии биологии и медицины, провозглашена перспектива развития новых тенденций в этой области в рамках интегрального подхода (integral approach) и интегральной биомедицины. С докладом "Биомедицинские исследования: между философией науки и философией медицины" выступил чл.-корр. РАН, проф. Б.Г. Юдин. Он отметил, что анализ традиционных методов исследования в философии медицины подкрепляет тезис о преимущественном когнитивистском понимании философии медицины. Доказательная медицина — квинтэссенция научного и когнитивистского подходов. Однако не все в медицине можно отнести к ведомству науки. Медицина — это еще и искусство, а объект медицины — человек страждущий. В своем докладе "Способствует ли совершенствование медицинских технологий развитию точной диагностики, или к вопросу о методологических основаниях современной медицины" д.ф.н., проф., зав. кафедрой философии и культурологии РГМУ им. Н.И. Пирогова И.З. Шишков остановился на вопросах методологического характера. Он отметил, что современная практическая медицина достигла высокого уровня развития, тогда как теоретическая медицина находится в кризисном состоянии. Проводя аналогии с состоянием физики начала ХХ века, докладчик сопоставил два типа рациональности: классический и неклассический в физике и, соответственно, в биомедицине. С докладом "Постнеклассика: соотношение традиции и новации" выступила д.ф.н., проф. кафедры философии, биомедэтики и гуманитарных наук МГМСУ, ведущий научный сотрудник Института философии РАН Л.П. Киященко. Она остановилась на дилемме понимания того, что есть традиция и что — новация в постнеклассической парадигме. В докладе "Биомедицинская этика — новая философская парадигма" д.ф.н., проф., зав. Кафедрой философии и политологии ММА им. И.М. Сеченова Ю.М. Хрусталёв остановился на проблеме, волнующей представителей всех специальностей. Физиками, биологами, философами, врачами высказывается тревога о будущем Жизни. Вся логика биоэтики направлена к одному — сохранению, сбережению жизни во имя здоровья человека. Биоэтика апеллирует прежде всего не к разуму, а к совести. Необходимо постигнуть смысл новой логики, понять назначение и смысл идей биомедицинской этики как новой морально-правовой парадигмы в сфере здравоохранения на основе философского переосмысления вечных проблем морали: добра и зла, смысла жизни, выбора своего пути. В докладе "Топика человеческого самопреобразования" д.ф.н., зав. сектором биоэтики и гуманитарных экспертиз Института философии РАН П.Д. Тищенко остановился на соотношении конструирования как новации и реконструирования как традиции в ситуации изменения идентичности человека. Д.ф.н., проф., зав. кафедрой биомедицинской этики РГМУ им. Н.И. Пирогова И.В. Силуянова выступила с докладом "Этическая экспертиза использования эмбриональных стволовых клеток". На Пленарном заседании с докладами также выступили: зав. отделом ИФРАН, проф. В.И. Аршинов — "Конвергирующие технологии и расширение возможностей человека"; д.б.н., проф. А.В. Олескин — "Биополитически важные тенденции эволюции живого"; зам. зав. отделом ИФРАН М.А. Пронин — "Homo virtualis в медицине и психологии". По итогам Пленарного заседания состоялся Круглый стол "Традиции и новации в отечественной и мировой философии биомедицины", где основные проблемы, поставленные в пленарных докладах, были обсуждены участниками в форме дискуссии и живого обмена мнениями. Далее работа конференции продолжилась в рамках секционных заседаний, которые проходили в различных секторах Института философии РАН. В рамках конференции состоялся телемост "Москва-Красноярск: традиции и новации в отечественной философии биомедицины". Его работа началась с представления заведующими кафедрами философии МГМСУ В.И. Моисеевым и Красноярского медицинского университета В.И. Кудашовым основных направлений учебной и научной деятельности кафедр. После знакомства с участниками телемоста и обмена мнениями о месте и задачах философского образования в подготовке специалистов медицинского профиля было продолжено обсуждение основных вопросов, настоящего положения и перспектив развития в этой области. Кроме сотрудников кафедры философии МГМСУ, с московской стороны в телемосте участвовали сотрудники Института философии РАН, кафедр философии Саратовского и Курского медицинских университетов. Дискуссия получилась плодотворной, были высказаны предложения по совместному сотрудничеству. Были намечены совместные перспективные планы научной и образовательной деятельности: совместное ведение рубрики "Диалог кафедр" в журнале "Сибирское медицинское обозрение"; проведение скрининг-исследования на тему проблем биоэтики в студенческой среде; подготовка и проведение совместной студенческой конференции. Дальнейшая работа конференции была продолжена в рамках секционных заседаний:
"История медицины, медицинское образование и саномедицина" (кафедра истории медицины МГМСУ) и "Трансдисциплинарные и теоретические аспекты биомедицины" (теоретический корпус МГМСУ, кафедра философии). Здесь же под руководством руководителя молодежной секции Московского философского общества, студента 5 курса МГМСУ А.А. Ильина прошло заседание молодежной секции, на которой с докладами и сообщениями выступили аспиранты и студенты МГМСУ, РГМУ, ММА, Рязанского государственного медицинского университета, Владимирского госуниверситета и др. На закрытии конференции, проходившем на кафедре философии, биомедицинской этики и гуманитарных наук МГМСУ, состоялось подведение итогов работы, а также были высказаны предложения по подготовке следующей 4-й конференции.
С.А. Доманова, доцент кафедры философии, биомедицинской этики и гуманитарных наук МГМСУ, к.ист.н.